记者了解到，有些机构利用自身地域优势，肆意抬高办证费用，让船员在不得已的情况下，不得不承担高额的花销。一船员委托机构办证，机构要求收取3000元的办证费，但船员本人却不知道这3000元的花费究竟包含了哪些项目，而因为无处可找，不得不接受这高昂的费用。

黑心机构办假证，危害船员。近来一船员在台州边检站办理换班手续，被检查出其所持海员证为伪造海员证。经调查发现，该船员看到办理海员证的广告，便委托中介办理相关证件，欲到外轮谋生，但其本人却对自己持伪假海员证一无所知，该船员也因此收到了行政处罚。

对于上述情况，分析人士指出，海员证个人申办政策实施后，船员能够自己或委托正规机构办理海员证，这能够有效的减少船员的损失，而非法办证机构也将受到严重的打击，相信未来的船员市场能够更加透明化、正规化。